生态环境部环境规划院独立运行与2001年，为独立法人事业单位。主要职责是：承担国家中长期环境战略规划、全国环境保护中长期规划与年度计划、污染防治和生态保护等专项规划、流域区域和城市环境保护规划等理论方法研究、模拟预测分析、研究编制拟定、实施评估考核等技术性工作；承担中央财政专项资金项目技术咨询、技术服务和绩效评估等工作；承担全国污染物减排计划、规划及其实施方案等方面研究拟订工作，承担污染物排放数据分析及环境统计方法、减排制度政策、环境容量测算、排污许可、排污交易及气候变化等方面的研究及技术支持工作；承担环境风险评估与管理、污染损害鉴定、经济损失评估等方面研究及技术支持工作；承担农村环境保护和农村源环境管理等与规划相关的技术支持工作；承担环境功能区划、生态功能区划等方面研究及技术支持工作；开展环境经济核算及与环境保护相关的财政经济政策、生态补偿政策、环境审计等方面研究工作。

目前全院有院士1人，研究员27名，副研究员（含高级工程师）53名，荣获“国家环境保护专业技术领军人才”2名，荣获“国家环境保护专业技术青年拔尖人才”4名，国务院特殊津贴获得者4名， 已经形成一支整体知识层次高、年龄结构合理、后备人才储备丰富的专业技术人才队伍。

连续多年被美国宾夕法尼亚大学“智库研究项目”（TTCSP）评选为全球 环境政策智库，在入选的中国智库中排名居首；连续多年被上海社会科学院智库研究中心评选为核心智库-专业性智库榜首。